Tout d'abord, qu'est-ce que le NGS et que fait-il?
Séquençage de nouvelle génération (NGS) est un outil qui a révolutionné de nombreux domaines d'études. Jusqu'à présent, le séquençage de l'ADN a joué un rôle important dans la biologie moléculaire, la biologie évolutive, la médecine, la médecine légale et plus encore, mais savez-vous qu'il peut jouer un rôle important dans le secteur du traitement de l'eau? Alors que notre courant ATP la technologie peut quantifier les microbes dans votre système, NGS fournira encore plus d'informations en identifiant presque tous les microbes présents ainsi qu'un aperçu de l'impact qu'ils ont sur vos processus. Il porte également d'autres noms que vous pouvez rencontrer, y compris Séquençage de deuxième génération (SGS) et séquençage massivement parallèle (MPS).
L'analyse NGS ouvre de grandes possibilités en vous aidant:
- Voir les tendances et comprendre les résultats futurs - pour une prise de décision proactive ou réactive
- Développer un plan de traitement personnalisé
- Ajuster l'utilisation du biocide
- Regardez les résultats de l'ADN dans une période beaucoup plus courte pour un coût beaucoup plus bas
Voici trois exemples de la façon dont les données NGS peuvent améliorer le processus industriel:
Machine à papier
Vous pouvez cibler la boue sur une machine à papier, ou même une feuille défectueuse pour déterminer précisément le type de microbes présents dans l'échantillon. Revenir en arrière dans le processus, examiner tous les nombreux flux d’intrants, permettrait de déterminer où les pires délinquants entrent dans le processus. Par dessus tout, LuminUltraLes tests NGS fournissent plus que l'abondance relative de chaque organisme. Il fournit également la concentration de ces cellules qui sont présentes. Cela est possible grâce à une combinaison de tests qPCR et NGS. Avec ces informations, vous pouvez choisir un biocide reconnu pour agir sur les organismes cibles et concentrer vos efforts sur les sites qui feront la plus grande différence!
Traitement des eaux usées
Imaginez un scénario où une usine de traitement des eaux usées connaît un problème de gonflement extrême. Une analyse microscopique traditionnelle est subjective et, par conséquent, peut provoquer un mauvais diagnostic des bactéries filamenteuses. Ce diagnostic erroné pourrait conduire les opérateurs sur une voie d'atténuation coûteuse qui pourrait ne donner aucun résultat. Une analyse métagénomique évite les erreurs de diagnostic et, en échantillonnant régulièrement, aide à prédire ces problèmes dès qu'ils commencent
Résistance biocide
Vous pouvez avoir une tour de refroidissement qui a été notoirement difficile à nettoyer. De plus, les coûts des biocides se sont avérés trop chers. Tous les biocides peuvent contrôler l'encrassement biologique, mais l'astuce consiste à trouver le biocide le plus rentable. Des tests NGS sur le biofilm et l'eau en vrac vous permettraient d'avoir une vue d'ensemble. Les oxydants sont une excellente forme de contrôle, mais peuvent souvent avoir du mal à pénétrer les biofilms. Un test révélant une forte abondance de champignons serait un moyen rapide d'éliminer l'utilisation de Quat seul comme solution car nous savons que ce n'est pas le traitement le plus efficace.
At LuminUltra, nous avons quelques différenciateurs qui aident à améliorer votre collecte de données.
Notre kit de conservation des échantillons vous permet de prélever votre échantillon sur le terrain et de le conserver facilement chimiquement. Pour cette raison, vous n'avez pas à vous soucier du refroidissement ou de l'expédition compliquée, ce qui peut être coûteux. Chaque test NGS est également livré avec un test qPCR. Le sujet de qPCR sera enregistré pour un autre article de blog. L'aspect le plus remarquable de la qPCR est qu'elle quantifie vos résultats.
Un échantillon typique de NGS est signalé en abondance, comme ceci:
| Organisme | Abondance |
| Runella | 3.58% |
| Nitrospira | 2.06% |
| Thauera | 14.30% |
| Zoogloea | 0.05% |
| Pseudomonas | 12.31% |
Cette abondance relative est utile, mais lorsque nous avons la capacité de compléter à la fois la qPCR en utilisant un test 16s et le séquençage de l'ARNr 16s, pourquoi ne pas faire les deux? Le résultat final est une quantification en cellules / ml qui peut être appliquée à toutes vos abondances pour produire quelque chose comme ça à la place:
| Organisme | Abondance | Quantité |
| Runella | 3.58% | Cellules 1,177,104 / mL |
| Nitrospira | 2.06% | Cellules 677,328 / mL |
| Thauera | 14.30% | Cellules 4,701,840 / mL |
| Zoogloea | 0.05% | Cellules 16,440 / mL |
| Pseudomonas | 12.31% | Cellules 4,047,528 / mL |
Et enfin, vous n'aurez pas à verser sur une grande feuille de calcul Excel avec 10,000 lignes de données. Notre tableau de bord NGS vous permettra de manipuler facilement vos données, d'examiner des groupes fonctionnels spécifiques tels que l'oxydation d'ammoniac et la réduction des sulfates, et de tracer / tendance au fil du temps.
Vous souhaitez en savoir plus sur la manière dont NGS peut contribuer à améliorer votre processus industriel? Demandez à voir notre démo aujourd'hui!
Société internationale de généalogie génétique
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