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bouteilles de bogues vs qpcr

Bug Bottles vs qPCR - Quelle est la différence?

Que sont les «bouteilles d'insectes»?

Comme souligné dans une précédente blog, les microbes peuvent causer toute une gamme de problèmes microbiologiques dans les processus d’extraction du pétrole et du gaz. En contrôlant la croissance microbienne, les opérateurs peuvent prévenir des problèmes tels que:

Diverses méthodes sont disponibles pour surveiller les niveaux de groupes de bactéries problématiques, tels que les producteurs d'acide et les réducteurs de sulfate. Une méthode qui a des antécédents bien établis est le test de culture avec le nombre le plus probable (MPN) avec dilution en série, souvent appelé «flacons d'insectes». Il s'agit d'une méthode visuelle, dans laquelle l'échantillon est dilué en série dans un certain nombre de flacons contenant milieu de croissance, laisser incuber, puis le NPP est estimé en fonction du nombre de bouteilles changeant de couleur.

La méthode de test de la culture MPN est simple et facile à interpréter, mais il y a quelques limitations:

  • Les temps d'incubation peuvent être importants, nécessitant jusqu'à 28 jours en fonction du microbe ciblé.
  • environ <1% des micro-organismes sont cultivables, de sorte que les résultats basés sur la culture peuvent sous-estimer considérablement la concentration totale ou surestimer l'efficacité du biocide.

Qu'est-ce que la qPCR?

Une excellente alternative qui a récemment gagné en popularité est réaction en chaîne de la polymérase quantitative (qPCR). Il s'agit d'une méthode basée sur l'ADN qui peut être utilisée pour détecter et quantifier rapidement les microorganismes dans des échantillons environnementaux ou industriels. Comme avec les tests de culture en dilution en série, différents dosages de qPCR peuvent être utilisés pour identifier les concentrations de groupes clés, tels que les procaryotes totaux, les procaryotes sulfato-réducteurs ou les bactéries réductrices de fer.

Contrairement aux méthodes basées sur la culture, la qPCR présente l'avantage d'être:

  • rapide, sensible et très spécifique.
  • les résultats peuvent être obtenus dans les heures 2.5 suivant le prélèvement de l’échantillon et ne reposent pas sur une croissance microbienne; il n’est donc pas limité à la détection de micro-organismes cultivables.
  • il peut également être utilisé pour traiter une variété de types d'échantillons, tels que les liquides, les solides et les coupons.

Historiquement, les tests de qPCR pouvaient être relativement complexes comparés aux tests basés sur la culture, mais LuminUltra's GeneCount® qPCR fournit une solution complète prête à l'emploi avec des kits d'analyse conçus et optimisés pour identifier les principaux organismes cibles dans les échantillons contaminés provenant d'installations industrielles, pétrolières et gazières et d'eaux usées. le GeneCount® qPCR test fournit également un excellent complément à 2nd Génération ATP® test, comme ATP peut être utilisé pour la surveillance courante au quotidien, tout en GeneCount® qPCR peut être utilisé pour une surveillance hebdomadaire ou mensuelle, avec des tests supplémentaires pour diagnostiquer les problèmes identifiés.


Brad Mcilwain

Brad McIlwain a plus de huit ans d'expérience dans le secteur de l'eau et des eaux usées. Avant de rejoindre LuminUltra, il a travaillé pendant plusieurs années en tant qu’ingénieur-conseil, où il a aidé à résoudre des problèmes complexes liés aux processus de traitement de l’eau et des eaux usées. Il s'intéresse particulièrement à la corrosion des systèmes d'eau. Au cours de sa maîtrise, ses recherches ont porté sur la qualité de l’eau et la corrosion dans les installations de plomberie. Brad aime être à l'extérieur et passer le plus de temps possible le week-end à camper, à faire de la randonnée et du vélo.

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