Mise à jour de janvier 2021
Vous avez peut-être récemment entendu parler de la réaction quantitative en chaîne par polymérase (qPCR) dans les nouvelles en tant que méthode de test de référence pour le COVID-19. Mais saviez-vous que cette technologie peut être utilisée pour tester les organismes nuisibles dans les processus industriels?
Identifier la présence d'organismes invasifs et potentiellement dommageables dans les processus industriels peut éviter aux entreprises des problèmes coûteux tels que la dégradation des produits, la corrosion des infrastructures et l'inhibition des processus. Les résultats sensibles, objectifs, rapides et spécifiques fournis par les tests qPCR donnent aux opérateurs système un nouvel outil puissant pour évaluer et gérer les risques.
Qu'est-ce que la qPCR?
La réaction en chaîne par polymérase quantitative (qPCR) est une méthode de test basée sur l'ADN qui détecte et quantifie rapidement les micro-organismes dans des échantillons environnementaux ou industriels.
Différents tests de qPCR sont utilisés pour identifier les concentrations de groupes clés, tels que les procaryotes totaux, les procaryotes sulfato-réducteurs ou les bactéries fer-réductrices.
qPCR peut être utilisé pour:
- Comprendre la relation de cause à effet que différents microbes ont sur les processus
- Voir les tendances et comprendre les futurs déclencheurs pour une prise de décision proactive ou réactive
- Appliquer des traitements plus ciblés, efficaces et rentables
Comment fonctionne qPCR?
Les tests qPCR impliquent des cycles de chauffage et de refroidissement qui servent à répliquer une séquence d'ADN (gène) spécifique d'un ou de plusieurs organismes cibles. Lorsque la séquence d'ADN cible est répliquée, la quantité d'une étiquette fluorescente augmente proportionnellement à la réplication de la séquence d'ADN cible. Cette fluorescence est directement mesurée en temps réel par l'instrument qPCR.
Le résultat des données brutes obtenu à partir d'un test est appelé seuil de cycle (Ct). Il indique à quel moment de la réaction la fluorescence de la cible a augmenté au-dessus du niveau de fluorescence de base. Combiné à une courbe standard créée en utilisant des concentrations connues de la séquence d'ADN cible, il est possible de calculer la quantité de copies de gènes présentes dans l'échantillon d'origine, qui peut être exprimée en concentration de copies de gènes / mL (ou de copies de gènes par gramme ou superficie).
Avec ces données, les opérateurs peuvent mieux comprendre quels microbes ont le plus d'impact - bon ou mauvais - sur leur système.
En quoi la qPCR diffère-t-elle des méthodes de test traditionnelles?
Les tests de culture via le comptage des plaques et les bouteilles d'insectes sont des méthodes de test populaires. Reconnu par les techniciens et les managers pour leur grande spécificité. Cependant, qPCR offre un certain nombre d'avantages:
- Rapide: Fournit des résultats en moins de 2 heures après le prélèvement des échantillons
- Flexible: Permet l'analyse de plusieurs échantillons et dosages en un seul passage
- Spécifique: Recherchez des microbes spécifiques ou des groupes de microbes importants pour votre processus
Historiquement, les tests de qPCR pouvaient être relativement complexes comparés aux tests basés sur la culture, mais LuminUltra's GeneCount®qPCR fournit une solution complète prête à l'emploi avec des kits d'analyse conçus et optimisés pour identifier les organismes cibles clés dans les échantillons contaminés provenant d'installations industrielles, pétrolières et gazières et d'eaux usées.
