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Tout ce que vous devez savoir sur qPCR

qPCR avec des résultats rapides et faciles à interpréter sera la clé

Alors que la réaction en chaîne par polymérase quantitative (qPCR) devient plus acceptée et disponible pour une gamme d'industries cherchant à quantifier leurs populations microbiennes (spécifiques), la capacité à fournir des résultats rapides et faciles à interpréter sera essentielle. Le développement initial des tests qPCR s'est concentré sur les agents pathogènes humains potentiels à utiliser par le secteur médical. Maintenant, de nombreux fabricants, y compris LuminUltra, proposent des tests à utiliser sur les marchés industriels non médicaux pour rechercher des organismes nuisibles connus dans les systèmes d'eau. S'ils ne sont pas détectés, ces mêmes organismes peuvent créer des problèmes coûteux, notamment la dégradation des produits, la corrosion des infrastructures et l'inhibition des processus.

 

Inconvénients actuels des méthodes de test traditionnelles

Les méthodes de test les plus répandues pour ces industries comprennent la culture via le comptage des plaques et les flacons d'insectes. Ces méthodes ont un haut degré de spécificité et sont approuvées par les techniciens et les gestionnaires. Cependant, ces techniques présentent des inconvénients.

Certains inconvénients incluent;

  • mesurer seulement une partie de la population totale
  • résultats subjectifs
  • délais de résultats longs (jours à semaines)

Il existe également des organismes, tels que les méthanogènes, qui ne sont pas facilement cultivables et ne peuvent pas être mesurés par les méthodes d'essai courantes.

 

qPCR est une méthode de haute technologie pour des informations utiles sur votre population microbienne

Les tests qPCR impliquent des cycles de chauffage et de refroidissement qui servent à répliquer une séquence d'ADN (gène) spécifique d'un ou de plusieurs organismes cibles. Lorsque la séquence d'ADN cible est répliquée, la quantité d'une étiquette fluorescente augmente proportionnellement à la réplication de la séquence d'ADN cible. Cette fluorescence est directement mesurée en temps réel par l'instrument qPCR.

Le résultat des données brutes obtenu à partir d'un test est appelé seuil de cycle (Ct). Il indique à quel moment de la réaction la fluorescence de la cible a augmenté au-dessus du niveau de fluorescence de base. Combiné avec une courbe standard créée en utilisant des concentrations connues de la séquence d'ADN cible, il est possible de calculer la quantité de copies de gènes présentes dans l'échantillon d'origine, et à partir du volume d'échantillon traité, une concentration de copies de gènes / mL (ou gène copies par gramme ou surface). Grâce à ces données, les opérateurs peuvent mieux comprendre quels microbes ont le plus d'impact - bon ou mauvais - sur leur système.

Les résultats sensibles, objectifs, rapides et spécifiques fournis par les tests qPCR donnent aux opérateurs de réseaux d'eau un nouvel outil puissant pour évaluer et gérer les risques. Pour plus d'informations, voir LuminUltra's GeneCount® solutions qPCR sur le terrain.


Mich<span>a</span>el  Thomas

Avec un B.Sc. En chimie médicinale et expérience de l'application et de la vente d'instruments de terrain et de laboratoire, Mike est notre spécialiste des sciences et de la technologie, également connu sous le nom de notre scientifique des applications. Le rôle de Mike consistera à faire en sorte que les clients exploitent pleinement notre plate-forme d’activation logicielle afin de tirer le meilleur parti de leurs données sur la qualité de l’eau. Ses passions sont la musique, la lecture, les grillades et la science, mais pas nécessairement dans cet ordre. Pendant les courts étés du Canada, il passe du temps à essayer les brasseries artisanales locales, à faire des excursions en voiture pour des concerts et à explorer les parcs et les sentiers de randonnée des Maritimes.

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