Shawn Watkins

Shawn est diplômé en génie chimique et possède une expérience de plusieurs années dans les domaines des ventes techniques, de la production et de l'amélioration de la qualité des produits dans l'industrie des pâtes et papiers. Comme l'un des LuminUltraKey Account Managers, il est chargé de proposer et de fournir des solutions de test microbien à des clients industriels pour diverses applications, notamment les pâtes et papiers, les eaux industrielles et les tours de refroidissement. Bien que Shawn réside en Ontario avec son épouse et son jeune fils, nous le revendiquons comme un Maritimer, car il est né et a grandi sur la côte est du Canada. Shawn est un fervent amateur de hockey et, bien qu'il vive en Ontario, il ne recherche pas les LEAFS. Nous allons essayer de garder ça secret pour Shawn.

Comment utiliser NGS pour améliorer mes processus industriels?

Tout d'abord, qu'est-ce que NGS?

Séquençage de nouvelle génération (NGS) est un outil qui a révolutionné de nombreux domaines d’études. Il va également par quelques autres noms que vous pouvez rencontrer, y compris Séquençage de deuxième génération (SGS) et séquençage massivement parallèle (MPS).

Et que fait NGS?

Jusqu'à présent, le séquençage de l'ADN a joué un rôle important dans la biologie moléculaire, la biologie évolutive, la médecine, la criminalistique, etc. Mais savez-vous qu'il peut jouer un rôle important dans le secteur du traitement de l'eau? Alors que notre courant ATP la technologie peut quantifier les microbes dans votre système, NGS fournira encore plus d'informations en identifiant presque tous les microbes présents avec un aperçu de l'impact qu'ils ont sur vos processus.

L'analyse NGS ouvre de grandes possibilités en vous aidant:
  • Observez les tendances et comprenez l'avenir - pour une prise de décision proactive ou réactive
  • Développer un plan de traitement personnalisé
  • Ajuster l'utilisation du biocide
  • Regardez les résultats de l'ADN dans une période beaucoup plus courte pour un coût beaucoup plus bas

Voici trois exemples de la manière dont les données NGS peuvent améliorer un processus industriel:

  1. Machine à papier

    Vous pouvez cibler la boue sur une machine à papier, ou même une feuille défectueuse pour déterminer précisément le type de microbes présents dans l'échantillon. Revenir en arrière dans le processus, examiner tous les nombreux flux d’intrants, permettrait de déterminer où les pires délinquants entrent dans le processus. Par dessus tout, LuminUltraLes tests NGS fournissent plus que l'abondance relative de chaque organisme. Il fournit également la concentration de ces cellules qui sont présentes. Cela est possible grâce à une combinaison de tests qPCR et NGS. Avec ces informations, vous pouvez choisir un biocide reconnu pour agir sur les organismes cibles et concentrer vos efforts sur les sites qui feront la plus grande différence!

  2. Traitement des eaux usées

    Imaginez un scénario dans lequel une usine de traitement des eaux usées était confrontée à un problème de gonflement extrême. Les analyses microscopiques traditionnelles sont subjectives et peuvent par conséquent entraîner un diagnostic erroné des bactéries filamenteuses. Cette erreur de diagnostic pourrait amener les opérateurs à s'engager dans une voie d'atténuation coûteuse susceptible de ne donner aucun résultat. Une analyse métagénomique évite les erreurs de diagnostic et, en procédant régulièrement à un échantillonnage, permet de prédire ces problèmes dès leur apparition.

  3. Résistance biocide

    Vous pouvez avoir une tour de refroidissement qui a été notoirement difficile à garder propre. De plus, les coûts des biocides se sont révélés trop coûteux. Tous les biocides peuvent contrôler l'encrassement biologique, mais le truc consiste à trouver le biocide le plus rentable. Les tests NGS sur le biofilm et l’eau en vrac vous permettraient d’avoir une vue d’ensemble. Les oxydants sont une excellente forme de contrôle mais peuvent souvent avoir du mal à pénétrer dans les biofilms. Un test révélant une abondance abondante de champignons serait un moyen rapide d'éliminer l'utilisation de Quat comme solution unique, car nous savons que ce n'est pas le traitement le plus efficace.

At LuminUltra, nous avons quelques différenciateurs qui aident à améliorer votre collecte de données.

Notre kit de conservation d'échantillons vous permet de prélever votre échantillon sur le terrain et de le conserver facilement par voie chimique. Pour cette raison, vous n'avez pas à vous soucier de le refroidir ou d'une expédition compliquée, ce qui peut être coûteux. Chaque test NGS est également accompagné d'un test qPCR. Le sujet de qPCR sera enregistré pour un autre article de blog. L’aspect le plus remarquable de la qPCR est qu’il quantifiera vos résultats.

Un échantillon typique de NGS est signalé en abondance, comme ceci:

OrganismeAbondance
Runella3.58%
Nitrospira2.06%
Thauera14.30%
Zoogloea0.05%
Pseudomonas12.31%

Cette abondance relative est utile, mais lorsque nous avons la possibilité de compléter à la fois la qPCR à l'aide d'un test 16s et le séquençage 16s, pourquoi ne pas faire les deux? Le résultat final est une quantification en cellules / ml qui peut être appliquée à toutes vos abondances pour produire quelque chose comme ceci à la place:

OrganismeAbondanceQuantité
Runella3.58%Cellules 1,177,104 / mL
Nitrospira2.06%Cellules 677,328 / mL
Thauera14.30%Cellules 4,701,840 / mL
Zoogloea0.05%Cellules 16,440 / mL
Pseudomonas12.31%Cellules 4,047,528 / mL

Enfin, vous n’aurez pas à utiliser une grande feuille de calcul Excel avec des lignes de données 10,000. Notre tableau de bord NGS vous permettra de manipuler facilement vos données, d’observer des groupes fonctionnels spécifiques tels que l’oxydation de l’ammoniac et la réduction des sulfates, et de tracer la tendance au fil du temps.

Vous souhaitez en savoir plus sur la manière dont NGS peut contribuer à améliorer votre processus industriel? Demandez à voir notre démo aujourd'hui!

Société internationale de généalogie génétique

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