Le besoin d'une méthode de purification d'ADN robuste qui ne nécessite pas de produits chimiques corrosifs et pourrait surmonter les types d'échantillons difficiles a conduit le développement de la GeneCount® méthode qKit Purifier. Cette méthode est basée sur la même méthodologie de référence utilisée dans l'ensemble de l'industrie du diagnostic moléculaire.
Purification de l'ADN à l'aide GeneCount® qKit Préserver et GeneCount® qKit Purify Auto (à l'aide d'un instrument d'autopurification) ou Standard (méthode manuelle) a été validé sur divers échantillons de champs pétrolifères.
Échantillons de champs pétrolifères, y compris eaux de reflux salines de fracturation hydraulique (fracking) ainsi que boue de raclage très visqueuse, ont été sélectionnés pour défier GeneCount® qKit Purify en raison de leur chimie complexe et de la présence de divers inhibiteurs de PCR.
Des expériences ont été réalisées pour valider la méthode améliorée de purification de l'ADN et sa compatibilité avec huit problèmes liés à la corrosion. GeneCount® Dosages qKit :
- Total procaryote
- Bactéries totales
- Archées totales
- Methanogens
- Procaryotes sulfato-réducteurs
- Bactéries oxydant le soufre
- Bactéries réductrices de fer
- Méthanogènes corrosifs (micH)
Ce résumé de validation comprend les sections suivantes :
- GeneCount® qKit Purify Auto comparaison avec purification d'ADN phénol:chloroforme
- Extraction et amplification réussies des cibles pour 8 tests qPCR liés à la corrosion à l'aide de GeneCount® qKit Purifier Auto
- GeneCount® qKit Purify Standard validation par rapport à un kit de purification d'ADN disponible dans le commerce
- Comparaison entre les méthodes d'agitation manuelle et de perturbation du vortex pour GeneCount® qKit Purify Standard