GeneCount® Collection Nitrifiants

Description

Les GeneCount® Nitrifiers Collection qPCR est conçu pour détecter quantitativement et estimer l’abondance des principaux groupes microbiens nitrifiants :

• Bactéries oxydantes de l'ammoniac (AOB)
• Archées oxydantes d'ammoniac (AOA)
• Bactéries oxydantes des nitrites (NOB) Groupe 1 (y compris Nitrospira)
• Bactéries oxydantes des nitrites (NOB) Groupe 2 (y compris Nitrobactérie)
• Comammox

Le panel d’analyses se compose de cinq analyses différentes qui peuvent être exécutées sur le même échantillon et fournissent un aperçu de l’abondance des principaux contributeurs au processus. L’efficacité de la méthode qPCR est obtenue grâce à la conception et à la validation d’amorces et de sondes spécifiques ciblant des marqueurs génétiques uniques associés à chaque groupe de micro-organismes nitrifiants.

Conception et optimisation des tests

Chaque test du panel est optimisé pour atteindre une spécificité et une sensibilité élevées pour son groupe de micro-organismes cible. Cela implique la sélection d'amorces et de sondes hautement spécifiques aux gènes cibles, minimisant ainsi la réactivité croisée avec l'ADN non cible. Le processus d'optimisation comprend également la détermination des températures d'hybridation, des concentrations d'amorces et des conditions de cycle appropriées pour maximiser l'efficacité de l'amplification.

Application et interprétation des données

Le panneau d'analyse qPCR de nitrification peut être appliqué à la surveillance environnementale, au dépannage/optimisation du traitement des eaux usées et à la recherche écologique pour quantifier l'abondance des micro-organismes nitrifiants. Il est particulièrement utile pour évaluer le processus de nitrification dans les systèmes de traitement des eaux usées industrielles et municipales où la conversion complète de l'ammoniac en nitrate est essentielle pour respecter les permis de rejet réglementés, pour surveiller le traitement de l'eau recyclée en vue d'une réutilisation industrielle et pour maintenir la santé de l'écosystème local.

Comprendre la dynamique de la nitrification

Les données quantitatives obtenues à partir des tests qPCR permettent de mieux comprendre les processus de nitrification et offrent une visibilité sur l'abondance des populations microbiennes clés responsables du processus de traitement. Des augmentations ou des diminutions de l'abondance de groupes nitrifiants spécifiques peuvent indiquer des changements dans la disponibilité de l'azote, la santé des populations ou des impacts de conditions environnementales nocives ou bénéfiques pour les organismes. Lorsque des changements sont observés, des mesures peuvent être prises pour corriger et optimiser le processus sur la base de ces indicateurs de processus clés.

Des informations quantitatives qui complètent 2nd Generation ATP et NGS

Combiné avec régulier ATP (qui fournissent l'activité globale de la population microbienne et les niveaux de santé) et l'analyse du séquençage de l'ADN (un instantané des organismes présents), le panel de tests qPCR de nitrification est un outil puissant pour surveiller et étudier les principaux acteurs du cycle de l'azote. En fournissant des informations quantitatives sur l’abondance de micro-organismes nitrifiants spécifiques, il aide à élucider la dynamique de la nitrification dans divers environnements.