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并排比较培养检测与 PCR 检测。

培养检测与 qPCR 检测军团菌

为什么 qPCR 检测已成为培养检测的有力替代方案

两种方法被广泛用于测试供水中军团菌的存在:培养测试和 聚合酶链反应 (PCR) 检测.

150 多年来,培养检测一直被用于诊断疾病。 在此过程中,它被称为检测各种细菌菌株的“黄金标准”,包括 退伍军人. 但是,在过去的几十年里,PCR(特别是定量 PCR 或 qPCR)测试已成为病原体检测的强大测试替代方案,因其速度、准确性和易用性而受到许多公共卫生专家的青睐。 一种 2013回顾 发现,在使用这两种方法的 28 项研究中,与培养检测相比,使用 qPCR 的 26 项检测出军团菌的比率更高。

让我们深入研究这些方法中的每一种,以及它们如何用于检测军团菌。

如何使用培养检测来检测军团菌?

培养测试是识别水源中军团菌存在的传统方法,例如 冷却塔. 培养是取水源中存在的细菌样本并使其在培养皿或其他培养基中生长一段时间,直到其可见并可进行分析的过程。

虽然培养测试是有效的,但当用作识别水源中军团菌的唯一方法时,它存在几个缺点。 其中最重要的是培养样本所需的时间(最多两周)。 从那时起 军团病爆发 有人怀疑,在仅通过培养测试确认其存在之前,可能会有更多人接触到细菌——在测试期间关闭建筑物可能不是一个可行的选择。

培养的另一个缺点是正确进行培养所需的专业设备和人员。 军团菌必须在高度控制的环境中培养——在合适的温度下并提供合适的营养——以避免繁殖错误的微生物,从而破坏样品。

更重要的是,军团菌通常在较大细胞的保护层中生长,称为 生物膜. 生物膜附着在内壁或管道上,并收集被常驻细菌吸收的营养物质。 当放置在培养皿上时,生物膜可能会阻止其中的生长,这使得培养它们变得困难。

qPCR 检测如何用于检测军团菌?

直到最近,培养测试仍被认为是检测环境中军团菌的最可靠方法。 但是最近生物技术的进步产生了一种方法,该方法已被证明可以提供更快、更准确的结果: qPCR测试.

qPCR 测试不是培养某些细菌来观察它们,而是从样本中分离脱氧核糖核酸 (DNA)。 这个过程需要存在的细菌数量要少得多,这意味着不需要培养样本来检测它。 因此,qPCR 测试可以 在两小时内识别样本中的军团菌 — 比培养测试快得多 — 同时还能检测那些有活力但不可培养 (VBNC) 的细菌,从而提供更完整的风险图。

无论是由于水系统中的化学处理还是被生物膜保护,细菌都可能处于休眠状态,不会在培养皿中生长。 这给培养测试带来了问题,但是,因为无论细菌是否处于休眠状态,DNA 仍然存在,所以 qPCR 测试可以识别样本中存在的休眠细菌。

CSZ CDC 建议同时使用这两种测试方法,在可能的情况下,在其制定军团病应对计划的指南中。

如何将 qPCR 结果转换为类似于培养方法?

由于许多操作员希望以他们熟悉的格式报告结果,因此可以将从qPCR反应获得的基因拷贝/ mL转换为近似细胞/ mL,这是基于基因拷贝平均数的计算根据文献调查确定的每种生物。

在 LuminUltra qPCR分析如 军团菌属 或总计 E。大肠杆菌 它们具有特定的基因定义目标,很容易从基因拷贝/mL 转换为细胞/mL,因为涵盖的所有物种都来自同一属,并且在基因上相似。

了解有关转换 qPCR 结果的更多信息。

 


LuminUltra 核心团队

公司成立于1995, LuminUltra 是一家总部位于加拿大的分子生物学诊断检测公司,业务遍及6个国家。 它是全球公认的为环境、工业和诊断监测应用开发测试和试剂的领导者,并且是加拿大政府 COVID-19 诊断测试试剂的主要供应商。

来自500多个国家的数十个财富80强客户信任 LuminUltra的技术,生产可靠性和卓越的客户服务历史,可以在安全的状态下提供基本服务。

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