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宏基因组学数据
迈克尔托马斯

有了理学士学位 在药物化学以及现场和实验室仪器的应用和销售方面,Mike是我们的“科技与技术”人,也被称为我们的应用科学家。 Mike的职责是确保客户充分利用我们的软件支持平台,以便他们能够充分利用他们的水质数据。 他的激情是音乐,阅读,烧烤和科学,但不一定按顺序排列。 在加拿大短暂的夏季,他花时间尝试当地的手工艺啤酒厂,参加音乐会的公路旅行以及探索Maritimes的公园和远足径。

充分利用元基因组学数据的四项重要准则

元基因组学是一个新兴领域。

元基因组学是一个快速发展的领域, 发表论文,提供新产品和服务 一年。 由于宏基因组学分析是微生物学中一个相对较新的领域,不同研究人员和公司仍在研究标准程序。 如果不同研究机构之间的结果具有可比性 公司, 重要的是 勤勉 被授予 宏基因组学程序。 A 评论 出版 由荷兰研究人员 临床微生物学和感染学专业 科学家可以遵循一系列基本准则,以帮助确保他们从宏基因组学数据中获得最大收益。 本文还解释了一些限制 用于报告目的的当前技术。

元基因组学数据的4条重要准则是:

采样: 重要的是要收集适当的样品进行测序。 在某些情况下,您需要代表性的样品,而在某些情况下,您将需要诊断性样品。 因此w提供简单易用的 5分钟 的DNA 保鲜盒that习惯于 防止运输过程中微生物群落的降解。

DNA提取: 用于提取和纯化DNA的方法将对回收的DNA产生影响,因此会影响测序结果。 这是一个 产品将 专业知识,这归功于我们丰富的提取经验 ATP 来自细胞 超过16 年份。

DNA制备: 在制备用于测序的DNA时,必须避免使用嵌合产物以确保数据质量。 如果PCR扩增产生嵌合序列 被允许 运行太多的循环–本质上是这些 科学怪人序列包含来自不同生物体DNA的位,并且看起来将是全新的生物体!

报告: 为了将原始的NGS数据解释并将其转换为有用的格式,需要一个高质量的生物数据库。 我们在处理包括石油和天然气,废水,饮用水和工业在内的各种行业的微生物方面拥有16年以上的经验,并且一直在不断地进入新的行业。 来自的NGS数据 LuminUltra 可以将生物分类为属级别,但不会在物种级别上详细介绍。 这是因为大多数生物的16S基因没有足够的信息来分类到物种水平。 使用此基因可以将某些生物分类为物种级别,但是 绝大多数 生物没有足够的种间多样性来使用这种方法进行区分。 尽管某些服务将分类到物种级别,但是由于假阳性识别的可能性增加,因此应格外谨慎地分析这些结果。

LuminUltra 致力于以一种易于理解的格式提供高级分析。 这使水系统的运营者和管理者可以独特地观察生活在其系统和过程中的生物。 有关NGS的更多信息,或要了解我们的其他可用产品和服务,请下载我们的 GeneCount 家庭 小册 or 联系我们.

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