肖恩沃特金斯

Shawn拥有化学工程学位,具有10多年在纸浆和造纸行业技术销售,生产和产品质量改进方面的经验。 作为其中之一 LuminUltra他是大客户经理,负责为工业客户提供微生物测试解决方案,用于各种应用,包括纸浆和造纸,工业用水和冷却塔。 虽然Shawn和他的妻子以及年幼的儿子住在安大略省,但我们在加拿大东海岸出生和长大时,他们声称自己是一名Maritimer。 Shawn是一名狂热的冰球迷,尽管他住在安大略省,但他并没有为LEAFS打球。 我们会尽力保持Shawn under。

如何使用NGS改善我的工业流程?

首先,什么是NGS?

下一代测序 (NGS)是一个彻底改变了许多研究领域的工具。 它还包括您可能遇到的其他一些名称 第二代测序 (SGS)和大规模并行测序(MPS)。 [1]

而且,NGS做什么?

到目前为止,DNA测序在分子生物学,进化生物学,医学,法医学等方面发挥了重要作用,但您是否意识到它可以在水处理领域发挥重要作用? 虽然我们目前 ATP 技术可以量化系统中的微生物, 通过识别几乎所有存在的微生物,NGS将提供更多的洞察力 并深入了解他们对您的流程产生的影响。

NGS分析可以帮助您:
  • 了解趋势并了解未来 - 主动与被动决策
  • 制定定制的治疗计划
  • 调整生物杀灭剂的使用
  • 以更低的成本在更短的时间内查看DNA结果

以下是NGS数据如何改善工业流程的三个例子:

  1. 纸机

    您可以将纸浆定位在造纸机上,甚至可以将纸张缺陷本身定位为样品中存在的微生物类型。 在此过程中向后移动,查看所有输入流,将能够识别最严重的违规者进入流程的位置。 首先, LuminUltraNGS测试提供的不仅仅是每种生物体的相对丰度。 它还提供了 存在的那些细胞的浓度。 这可以通过qPCR和NGS测试的组合来实现。 有了这些信息,您可以选择已知可用于目标生物的杀菌剂,并将您的努力集中在能够发挥最大作用的位置!

  2. 废水处理

    想象一下,废水处理厂遇到极端膨胀问题的情景。 传统的基于显微镜的分析是主观的,因此可能导致丝状细菌的误诊。 这种误诊可能导致运营商失去一条可能无法产生结果的昂贵缓解路径。 宏基因组分析可以避免误诊,并通过常规抽样,帮助预测这些问题。

  3. 杀菌剂抗性

    您可能有一个众所周知难以保持清洁的冷却塔。 此外,杀菌剂成本已被证明过于昂贵。 所有生物杀灭剂都可以控制生物污染,但诀窍是找到最具成本效益的杀菌剂。 对生物膜和大量水进行NGS测试可以让您查看整个图片。 氧化剂是一种很好的控制形式,但通常难以渗透生物膜。 显示大量真菌的测试将是消除单独使用Quat作为解决方案的快速方法,因为我们知道这不是最有效的治疗方法。[2]

At LuminUltra,我们有一些差异有助于改善您的数据收集。

我们的样品保存套件可让您在现场采集样品并轻松化学保存。 出于这个原因,您不必担心冷却或复杂的运输,这可能是昂贵的。 每个NGS测试也都带有qPCR测试。 qPCR的主题将保存为另一篇博客文章。 qPCR最值得注意的方面是它会量化您的结果。

报告了一个典型的NGS样本,如下所示:

生物 丰富
Runella 享受3.58%
硝化 享受2.06%
Thauera 享受14.30%
菌胶团 享受0.05%
假单胞菌 享受12.31%

这种相对丰度是有用的,但是当我们有能力使用16s测定和16s rRNA测序完成qPCR时,为什么不同时进行? 最终结果是以细胞/ mL为量化,可以应用于所有丰度,以产生类似的东西:

生物 丰富 数量
Runella 享受3.58% 1,177,104细胞/ mL
硝化 享受2.06% 677,328细胞/ mL
Thauera 享受14.30% 4,701,840细胞/ mL
菌胶团 享受0.05% 16,440细胞/ mL
假单胞菌 享受12.31% 4,047,528细胞/ mL

最后,您不必为具有10,000行数据的大型Excel电子表格倾倒。 我们的NGS仪表板将允许您轻松操纵您的数据,查看特定的功能组,如氨氧化和硫酸盐还原,以及随时间推移的绘图/趋势。

有兴趣了解有关NGS如何帮助改善您的工业流程的更多信息? 今天要求看看我们的演示!

[1] 国际遗传谱系学会

[2] 保护材料的MICROBICIDES目录 - 保罗书

订阅我们的电子报

获取我们的月刊

  • 此字段是为了进行验证,并应保持不变。

© 2019 LuminUltra |